はい。コントロールパネルで変更することができます。
コントロールパネルのログイン方法は下記QAをご参照ください。
・ コントロールパネルのログイン方法
https://support.denet.co.jp/support/solutions/articles/67000746942
1コントロールパネルにログイン後、「ウェブサイトとドメイン」が表示されましたら、「メール」をクリックします。
2 メールアドレス一覧が表示されましたら、メールのボックスサイズを変更されるメールアドレスをクリックします。
3「メールボックス」で「別サイズ」を選択→サイズを指定後、「OK」をクリックします。
4 使用量が変わりましたら、設定変更完了です。